Die Verantwortung für die Führung der Schule als Ganzes enthält verschiedene Elemente. Die Schulpflege genehmigt die Entwicklungsziele, die Konzepte und die spezifischen Regelungen ihrer Schule, überprüft die Umsetzung und die Wirksamkeit der Massnahmen, überwacht die Einhaltung der kantonalen Vorgaben und der lokalen Vereinbarungen, führt die Schule strategisch und arbeitet mit dem Gemeinderat sowie anderen Partnern zusammen.
Die Schulleitung der Schule Bergdietikon ist verantwortlich für die operative Führung der Schule. Sie ist Ansprechpartnerin für organisatorische, personelle und pädagogische Fragen und vertritt die Schule nach aussen. Die Schulleitung wird durch eine professionelle Schulverwaltung unterstützt.